Бактериофаги являются самой распространенной формой жизни на земле, и их взаимодействие с бактериями-хозяевами часто описывают в терминах “гонки вооружений”. В последние годы были открыты десятки новых систем бактериального противовирусного иммунитета, и мы изучаем принципы их активации, механизмы действия, а также вирусные антизащитные стратегии. В работе сочетаются методы сравнительной геномики, микробиологии, биохимии и структурной биологии. Бактериофаги также рассматриваются как средство для борьбы с патогенными бактериями. Мы выделяем новые виды фагов и изучаем различные факторы, влияющие на успешность заражения бактериальных клеток.

Лаборатория анализа метагеномов была основана в Сколтехе в 2022 году в рамках проекта «Атлас микробных сообществ Российской Федерации». Цель лаборатории — охарактеризовать разнообразие микроорганизмов в малоизученных природных средах, в частности в экосистеме Северного Ледовитого океана. В сотрудничестве с Центром морских исследований МГУ было собрано около 10.000 образцов и проведен анализ состава микробных сообществ, а также получено 200 полных метагеномов. Эта беспрецедентная база данных микробных геномных последовательностей представляет собой богатый источник для поиска новых ферментов, CRISPR-Cas генетических редакторов и кластеров синтеза биологически активных веществ.