7-11 июля 2024 г. в Пуэрто-Вальярте (Мексика) прошла конференция SMBE 2024 под эгидой Общества молекулярной биологии и эволюции.

На конференции аспирант центра молекулярной и клеточной биологии Сколтеха Екатерина Рюмина представила работу «Избегание презентирования на HLA класса I является движущей силой эволюции SARS-CoV-2» в соавторстве с Евгенией Алексеевой, Галиной Клинк и Георгием Базыкиным, где рассказала, что эволюция SARS-CoV-2 тесно связана с адаптивным иммунитетом человека.

Известно, что мутации, позволяющие избегать ответа В-клеток, обеспечивают селективное преимущество и поэтому распространяются в популяции. Между тем, роль избегания цитотоксического Т-клеточного ответа остается спорной. В данной работе авторы изучают происхождение и распространение вариантов SARS-CoV-2, которые позволяют избегать презентирования на HLA класса I. Учёные обнаружили, что 35% мутаций, характерных для ВОК, и 34% мутаций, достигших высоких (>5%) частот в вирусных популяциях, способствуют избеганию Т-клеток. Мутации, связанные с избеганием распространенных HLA аллелей, достигают более высоких частот, чем мутации, позволяющие избегать менее распространенных HLA аллелей. Более того, вирусные мутации, позволяющие избегать цитотоксического Т-клеточного ответа, достигают более высоких частот в тех странах, где соответствующие HLA аллели встречаются чаще. Вместе эти данные указывают на то, что избегание цитотоксических Т-лимфоцитов является важным движущим фактором эволюции SARS-CoV-2 и эпидемиологической проблемой. Исследование было поддержано грантом РНФ № 21-74-20160.