Разработка моделей и методов оценки генома. Интеграция различных источников информации (родословная, генотипы, последовательности, фенотипы) с целью как можно более ранней оценки селекционных кандидатов у сельскохозяйственных животных. Внедрение метода импутации генотипа для снижения затрат на генотипирование и расходов на программу разведения.

Разработка программ скрещивания на основе генома. Определение наилучшего возможного сочетания пород и максимизация прибыльности за счет оптимизации скрещивания между животными разных пород.
Построение индекса отбора для российской системы производства и ценообразования. Разработка методов отбора и развитие направления разведения с использованием оценки относительной важности признаков на основе особенностей производственной системы, анализа затрат и доходов и политики предприятия.

Оптимизация спаривания, чтобы избежать депрессии производства и финансовых потерь из-за инбридинга. Анализ генетического разнообразия с использованием различных подходов и разработка идеального спаривания с минимальной потерей генетического разнообразия.

Разработка вспомогательных систем принятия решений для управления стадом. Разработка индивидуальных информационных панелей для управления крупными животноводческими фермами и, в частности, упрощение программ селекции и разведения.