Междисциплинарный характер программы Сколтеха «Инженерные системы» включает аспекты современной инженерии, системного мышления и механизмов решения сложных технологических и общественных проблем. Программа предназначена для подготовки нового поколения учёных и инженеров, способных проводить независимые исследования, разрабатывать инновационные решения и стратегии, решая задачи в широком спектре отраслей. Высококвалифицированные преподаватели Сколтеха сопровождают будущих специалистов на пути к получению экспертных знаний в выбранной ими области, помогают развить навыки применения фундаментальных знаний и научных теорий в исследовательской работе, а также обучают анализу потребностей высокотехнологической индустрии и общества в целом для достижения лучшего и более устойчивого будущего для всех. Для студентов открыты возможности сотрудничества с индустриальными партнерами и участия в проектах реального сектора, благодаря которым обучающимся за короткий период удаётся приобрести практический опыт и развить профессиональные навыки. Таким образом, в дополнение к фундаментальным техническим компетенциям аспиранты данной программы развивают передовые компетенции, востребованные работодателями во всем мире; такие навыки как постановка и решение сложных проблем, командная работа в различных условиях, составление отчётов, устная и письменная коммуникация на английском языке и многое другое.